2005年9月19日李敖赴大陆展开“神州文化之旅”，行程包括香港、北京和上海。过程中，分别于北京大学、清华大学和复旦大学进行了演讲，自认为演讲的目的在于向大陆人民“播撒自由主义的种子”，复旦大学姜义华教授认为，李敖是自由主义的实践者。
暨大汕大厦大演讲
2011年四月李敖先生再次来到大陆，北上广东福建两省，参访暨南大学，汕头大学，厦门大学。2011年4月1日，在暨南获封名誉教授，为纪念辛亥革命100周年，李敖在广州暨南大学参加“百年暨南文化素质教育讲堂”，做了题为《黄花岗第七十三烈士》的讲座。2011年4月2日，台湾作家、历史学家、文化学者、时事批评家李敖先生和美国波士顿学院终身教授、汕头大学客座教授潘毓刚在汕大对话，对话题目为“X计划‘思辨进行时’之大师对话”。在汕头大学讲演完后喉咙发炎，是日在厦门记者见其胸前挂着卡片，“喉咙发炎，只能对你笑”。
2011年7月20-26日举行的名家讲座系列第十二讲，李敖做“中国知识分子的走向”讲座。
拍卖义捐李敖为救助台湾慰安妇，拍卖自己收藏的字画古董，包括胡适曾经送给他的书法作品等，总共捐出一百万美金，约合三千三百多万新台币，轰动一时。
参与节目李敖曾担任台湾、香港的一系列电视政论节目的嘉宾、主评，针砭时弊，各方反应不一。总的来说在大陆的有抱负、有思想的年轻人心中反应最为强烈，许多人都视他为权威，但另有些人则对他嗤之以鼻，注入了较多的个人偏见。其晚期的一些作为也颇受争议。除了对台湾政治心直口快的批判，引致许多泛绿者的不满以外，对马英九的批评与对宋楚瑜的维护，让他在泛蓝阵营中也遭到不少反对。他对同性恋者与新加坡的意见遭部分人士反弹。
几次入狱
李敖不断著文尖锐地批判中国传统文化，又主张“全盘西化”，因而在岛内曾掀起一场文化论战的风波。蒋介石亲下“该书店应即迅速设法予以封闭”的手令，导致《文星》被封。至一九六七年四月，以“妨害公务”罪被提起公诉。曾两度以叛乱罪系狱。（《中华文学通史·第十卷·当代文学编》中国社会科学院编）
第一次入狱（1971年3月－1976年11月）：罪状为台独，实属冤狱。李敖于1970年开始被国民党当局软禁，前后长达十四个月，直到1971年3月被捕。于1972年3月10日正式判决，李敖被判十年大狱。警总军法处乱判李敖叛乱的“主文”是： 李敖预备以非法之方法颠覆“政府”，处有期徒刑十年，褫夺公权六年。 但是时任军事检察官的韩延年说判得太轻，提出声请书，于是复判开始，直拖到三年半后，李敖在被景美军法看守所关押四年八个月后，于1975年12月22日被移送至土城“仁爱教育实验所”。后在1976年11月19日服刑五年八个月期满，无保出狱。
第二次入狱（1981年8月－1982年2月）：
表面上是普通刑事案件，即萧孟能诬告李敖案。实质上是第二次政治犯入狱，台湾当局利用萧孟能诬告李敖案，对李敖进行再次“封杀”。这件案子，根本原因在萧孟能抛弃了四十年同甘共苦的发妻朱婉坚，李敖仗义执言，因而触怒了萧孟能和他姘妇王剑芬。李敖自述“我是与他们夫妇一起在《文星》共事多年的见证人，我亲眼看到朱婉坚如何既婉且坚的帮萧孟能赚了这些财产，如今这样子被扫地出门，我不能沉默，我要打抱不平。为了这一打抱不平，我付出了昂贵的代价。萧孟能居然受姘妇挑唆，翻脸无情无义，利用我帮他料理水晶大厦一件事做切入点，诬告我侵占。”一开始，台北地方法院陈联欢法官判李敖无罪，但到了“高等法院”后，林晃、黄剑青、顾锦才三法官却希旨承风、玩法弄权，判李敖坐牢半年。李敖自述“判决内容之蹊跷已到了离奇程度，一、三法官竟不承认亲笔字据 二、三法官竟不承认科学鉴定三、三法官竟窜改笔录 四、三法官竟代栽证据 五、三法官竟捏造配偶 六、三法官竟歪曲情理 七、三法官竟对银行作业茫然无知。”李敖出狱后，锲而不舍，追究出萧孟能诬告内情。那时政治因素已结案，法官们乃依法判决，诬告李敖的萧孟能失掉政治靠山，前后两次入狱，萧孟能被李敖告到被通缉，最后逃亡海外。
入驻微博2011年5月在新浪力邀之下，李敖以“哈啰李敖”的ID正式入驻新浪微博，第一天24小时内发了31条微博，而后坚持原创无一条转发堪称微博奇迹，引来三百万粉丝强力关注。起初，李敖对微博颇具好感，称微博能帮其利用零碎时间，抢救零碎灵感。但同时李敖也表示，140字，写好了不容易，遗憾的是读者通过这140字无法看到一个真正的李敖，“通过微博只能看到140字，真正的我你们看不到，那个我是大江大河，通过微博看我，就像看冰山一样，你只能看到八分之一，甚至八十分之一的李敖”。
而开通后月余，因话题敏感，李敖言论遭新浪屏蔽，自由主义大师奋起反抗，扬言关闭微博，罢写！最终新浪妥协，不仅放低姿态挽留李敖，更写下书面凭证，维护李敖言论自由。维权事件李敖胜出，新浪也终于留住了微博大户。
2011年10月17日，李敖暂停了微博写作。时隔一年多，2013年1月13日，李敖重新开始微博写作，频率是每日一篇。截至2015年10月，粉丝数量达1018万。
状告小S北京时间2011年5月10日消息，据香港东方日报报道，台湾艺人徐熙娣（小S）为撑姐姐徐熙媛（大S）而被作家李敖控告诽谤。李敖表示已委请律师对艺人小S提出加重诽谤罪告诉，他不要金钱赔偿也不要道歉，但要求上庭前先上小S的节目《康熙来了》辩论3场。至于是否要告大S，李敖则表示要再研究。对于小S丈夫许雅钧“卖屋护妻”言论，李敖毫不留情指有人说话欠逻辑。
李敖日前在新书发表会上，对大S婆婆张兰很有意见，小S为了护姐姐，脱口调侃：“他是暗恋兰姐，我们吵不过他，就只能认为他用这种方式在隐性示爱。”双方隔空交火，导致李大师杠上小S。
